入职公司外地员工可以在南京交社保，具体缴纳方式如下：

一、缴纳条件

单位条件：

单位在南京设有分支机构或办事处，并且该地的社保政策允许单位直接在当地缴纳社保。

或者单位通过第三方人力资源服务机构在南京代为缴纳社保。

员工条件：

员工与南京的单位签订劳动合同，成为该单位的正式员工。
 

二、缴纳流程

开设社保账户：

单位需要在南京的社保经办机构开设社保账户，提交相关文件和材料，如单位营业执照、税务登记证、组织机构代码证等。

确定缴费基数：

社保缴费基数是根据职工上一年度的月平均工资确定的。如果职工月平均工资低于南京社保规定的最低缴费基数，则按最低缴费基数缴纳;如果高于最高缴费基数，则按最高缴费基数缴纳。

缴纳社保费用：

单位需要按照南京的社保政策和规定，定期向社保账户缴纳社保费用。这些费用包括养老保险、医疗保险、工伤保险、失业保险和生育保险等。

员工个人部分由单位代扣代缴。

三、缴纳方式

单位缴纳：

单位通过银行转账等方式将社保费用缴纳至南京的社保经办机构指定的账户。

个人缴纳(如适用)：

对于南京本地户口的自由职业者或未就业人员，可以个人身份在南京的社保局申请办理社保缴纳。但入职公司的外地员工通常通过单位缴纳，个人无需单独办理。

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四、注意事项

合规性：

单位在异地缴纳社保时，需要仔细了解南京的社保政策和规定，并咨询专业人士的意见，以确保合规缴纳。

及时性：

单位需要确保及时、足额地缴纳社保费用，以保障员工的社保权益。

社保转移：

如果员工之前在其他地方缴纳过社保，需要办理社保转移手续，将社保关系转移至南京。

咨询与查询：

员工可以通过南京的社保经办机构提供的渠道(如电话、网站等)查询个人社保缴纳情况。

综上所述，入职公司的外地员工可以在南京交社保，但需要满足一定的条件和流程。单位需要开设社保账户、确定缴费基数并缴纳社保费用，而员工则通常通过单位缴纳个人部分。在缴纳过程中，需要注意合规性、及时性和社保转移等问题。