公司缴纳社保与个人缴纳社保存在以下区别：

一、参保主体与缴费方式

公司缴纳社保

参保主体：用人单位及其职工。

缴费方式：由用人单位统一办理参保手续，并从职工的工资中代扣代缴个人应承担的社保费用。

个人缴纳社保

参保主体：无雇工的个体工商户、未在用人单位参加社会保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员。

缴费方式：个人自行前往社保经办机构办理参保手续，并承担全部社保费用。
 

二、参保险种与缴费比例

公司缴纳社保

参保险种：一般包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险(部分地区已合并为医疗保险)。

缴费比例：养老保险单位缴费比例一般为16%左右，个人缴费比例为8%;医疗保险单位缴费比例一般为6%左右，个人缴费比例为2%;失业保险、工伤保险和生育保险的缴费比例由各地规定，单位承担大部分费用，个人承担较少或无需承担。

个人缴纳社保

参保险种：通常只能参加基本养老保险和基本医疗保险，部分地区允许参加失业保险，但无法参加工伤保险和生育保险。

缴费比例：养老保险缴费比例一般为20%左右，全部由个人承担;医疗保险缴费比例一般为8%左右，全部由个人承担。失业保险的缴费比例由各地规定，一般较低。

三、缴费基数与缴费金额

公司缴纳社保

缴费基数：以职工上年度月平均工资为基数，但不得低于当地最低缴费基数，也不得高于最高缴费基数。

缴费金额：根据缴费基数和缴费比例计算得出，单位和个人分别承担相应部分。

个人缴纳社保

缴费基数：个人可以根据自身情况选择缴费档次，缴费档次通常与当地社平工资挂钩，分为多个档次供个人选择。

缴费金额：根据缴费基数和缴费比例计算得出，全部由个人承担。

四、社保待遇与权益

公司缴纳社保

社保待遇：职工在享受养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险待遇时，待遇标准较高，且符合规定的可以享受相应的补贴和津贴。

权益保障：用人单位必须为职工缴纳社保，这是法定义务。职工在享受社保待遇的同时，也享有相应的权益保障。

个人缴纳社保

社保待遇：个人在享受养老保险和医疗保险待遇时，待遇标准可能低于职工待遇，且无法享受工伤保险、生育保险和失业保险待遇。

权益保障：个人缴纳社保属于自愿行为，不受法律强制。在享受社保待遇时，可能存在一定的限制和不确定性。

五、其他注意事项

参保地限制：公司缴纳社保通常不受户籍限制，只要职工在工作地参保即可。而个人缴纳社保可能受到户籍限制，部分地区要求个人必须在户籍所在地参保。不过，随着政策的不断完善，一些地区已经放宽了个人缴纳社保的户籍限制。

缴费连续性：公司缴纳社保通常具有连续性，只要职工在职期间按时缴费即可。而个人缴纳社保可能因各种原因导致缴费中断，影响社保待遇的享受。因此，个人在缴纳社保时需要注意保持缴费的连续性。

退休规定：公司缴纳社保的职工在达到法定退休年龄且累计缴费满一定年限时，可以办理退休手续并享受养老金待遇。而个人缴纳社保的灵活就业人员退休规定可能因地区而异，需要参照当地政策执行。

综上而论，公司缴纳社保与个人缴纳社保在参保主体、参保险种、缴费比例、缴费基数、社保待遇等方面存在显著差异。对于在职人员来说，公司缴纳社保是更为合适的选择;而对于灵活就业人员来说，则可以根据自身情况选择个人缴纳社保。